Ołtarz Wita Stwosza jest niewątpliwie najznakomitszym dziełem znajdującym się w Bazylice Mariackiej. Został on wykonany w ciągu 12 lat (1477 -1489) przez mistrza Wita Stwosza i jest jednym z cenniejszych drewnianych ołtarzy z okresu gotyku. Znajduje się w nim ok. 200 figur, a największe z nich mierzą ok 3 metrów wysokości. Figury te przedstawiają sceny z życia Najświętszej Marii Panny. Konstrukcja jest wykonana w drewnie dębowym, a rzeźby w drewnie lipowym. Ołtarz przetrwał szczęśliwie wojny, oblężenia, rabunki i pożary nękające Kraków. W czasie II wojny światowej na początku 1940 roku został rozebrany przez Hitlerowców i wywieziony w głąb Rzeszy Niemieckiej. W dniu 30 IV 1946 roku dzieło Stwosza powróciło do Krakowa.